Najbolj izrazite regije z okuženimi klopi so Notranjska, Gorenjska, Koroška in Ljubljana z okolico
S klopnim meningoencefalitisom se letno okuži približno 100 ljudi. Strokovnjaki opozarjajo, da je precepljenost prenizka. Okužba lahko pusti trajne posledice, v nekaterih primerih je bolnike treba predihavati do konca življenja.